Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SALL1Q9NSC2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SALL1Q9NSC2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SALL1Q9NSC2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SALL1Q9NSC2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms