Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TULP4Q9NRJ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TULP4Q9NRJ4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TULP4Q9NRJ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms