Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC4Q9NPG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZDHHC4Q9NPG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms