Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA8Q9NP80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA8Q9NP80 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms