Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM55Q9BYV6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM55Q9BYV6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM55Q9BYV6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM55Q9BYV6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM55Q9BYV6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms