Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRA6Q9BX79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRA6Q9BX79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRA6Q9BX79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms