Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SGIP1Q9BQI5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGIP1Q9BQI5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SGIP1Q9BQI5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms