Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRX2Q99811 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRX2Q99811 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRX2Q99811 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRRX2Q99811 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRRX2Q99811 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRX2Q99811 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRX2Q99811 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRRX2Q99811 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms