Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCNX1Q96RV3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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