Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CAMKK2Q96RR4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CAMKK2Q96RR4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CAMKK2Q96RR4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMKK2Q96RR4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CAMKK2Q96RR4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CAMKK2Q96RR4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms