Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IPQ96QF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IPQ96QF0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms