Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BICD1Q96G01 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BICD1Q96G01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms