Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF34Q969K3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF34Q969K3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms