Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEDD2Q8WXF8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEDD2Q8WXF8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEDD2Q8WXF8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEDD2Q8WXF8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms