Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRF4Q8WWF5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF4Q8WWF5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms