Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC12Q8WVT3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC12Q8WVT3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC12Q8WVT3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms