Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf43Q8TAL5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf43Q8TAL5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms