Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LPCAT1Q8NF37 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT1Q8NF37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms