Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACBD4Q8NC06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms