Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00612Q8N6U2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms