Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RYBPQ8N488 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RYBPQ8N488 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms