Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC43Q8N309 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC43Q8N309 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms