Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC2Q6ZN30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC2Q6ZN30 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNC2Q6ZN30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms