Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFWD3Q6PCD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFWD3Q6PCD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms