Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPH2Q6IBW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPH2Q6IBW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms