Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC19Q6DKK2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms