Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIGD3Q6B0B8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD3Q6B0B8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD3Q6B0B8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms