Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TCERG1LQ5VWI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCERG1LQ5VWI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms