Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPRD2Q5VT52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RPRD2Q5VT52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RPRD2Q5VT52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RPRD2Q5VT52 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms