Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM1Q2NKQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM1Q2NKQ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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