Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGISQ16647 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGISQ16647 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms