Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA6Q15825 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA6Q15825 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA6Q15825 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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