Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB33AQ14088 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB33AQ14088 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms