Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA4Q13772 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA4Q13772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
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