Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SQSTM1Q13501 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQSTM1Q13501 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQSTM1Q13501 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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