Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
GRIN2BQ13224 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
GRIN2BQ13224 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GRIN2BQ13224 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
GRIN2BQ13224 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2BQ13224 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
GRIN2BQ13224 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
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