Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1BQ13112 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAF1BQ13112 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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