Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL28Q13084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRPL28Q13084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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