Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELP6Q0PNE2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELP6Q0PNE2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELP6Q0PNE2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms