Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LOXL1Q08397 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms