Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC1Q01954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC1Q01954 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms