Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB25P57735 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB25P57735 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB25P57735 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB25P57735 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB25P57735 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB25P57735 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB25P57735 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB25P57735 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB25P57735 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB25P57735 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB25P57735 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB25P57735 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB25P57735 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB25P57735 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB25P57735 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB25P57735 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB25P57735 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB25P57735 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB25P57735 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB25P57735 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB25P57735 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB25P57735 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB25P57735 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB25P57735 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB25P57735 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB25P57735 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB25P57735 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB25P57735 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB25P57735 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB25P57735 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB25P57735 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB25P57735 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB25P57735 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB25P57735 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB25P57735 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB25P57735 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB25P57735 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB25P57735 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms