Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A3P57103 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A3P57103 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A3P57103 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A3P57103 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms