Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BACE1P56817 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BACE1P56817 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BACE1P56817 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BACE1P56817 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BACE1P56817 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BACE1P56817 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BACE1P56817 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BACE1P56817 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BACE1P56817 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BACE1P56817 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BACE1P56817 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BACE1P56817 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BACE1P56817 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BACE1P56817 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BACE1P56817 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BACE1P56817 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BACE1P56817 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BACE1P56817 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BACE1P56817 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BACE1P56817 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BACE1P56817 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BACE1P56817 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BACE1P56817 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BACE1P56817 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BACE1P56817 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BACE1P56817 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BACE1P56817 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BACE1P56817 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BACE1P56817 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BACE1P56817 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BACE1P56817 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BACE1P56817 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BACE1P56817 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BACE1P56817 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BACE1P56817 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BACE1P56817 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BACE1P56817 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BACE1P56817 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BACE1P56817 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BACE1P56817 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BACE1P56817 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BACE1P56817 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BACE1P56817 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BACE1P56817 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BACE1P56817 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BACE1P56817 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BACE1P56817 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BACE1P56817 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BACE1P56817 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BACE1P56817 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BACE1P56817 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BACE1P56817 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BACE1P56817 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BACE1P56817 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BACE1P56817 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BACE1P56817 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BACE1P56817 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BACE1P56817 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BACE1P56817 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BACE1P56817 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BACE1P56817 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BACE1P56817 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BACE1P56817 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BACE1P56817 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BACE1P56817 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BACE1P56817 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BACE1P56817 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BACE1P56817 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms