Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC13P55735 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC13P55735 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC13P55735 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC13P55735 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC13P55735 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC13P55735 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC13P55735 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC13P55735 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC13P55735 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC13P55735 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC13P55735 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC13P55735 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC13P55735 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC13P55735 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC13P55735 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC13P55735 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC13P55735 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC13P55735 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC13P55735 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC13P55735 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC13P55735 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC13P55735 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC13P55735 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC13P55735 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC13P55735 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC13P55735 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC13P55735 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC13P55735 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC13P55735 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC13P55735 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC13P55735 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC13P55735 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC13P55735 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC13P55735 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC13P55735 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC13P55735 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC13P55735 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC13P55735 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC13P55735 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC13P55735 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC13P55735 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC13P55735 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC13P55735 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC13P55735 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC13P55735 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC13P55735 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC13P55735 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC13P55735 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC13P55735 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC13P55735 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC13P55735 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC13P55735 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC13P55735 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC13P55735 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC13P55735 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC13P55735 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC13P55735 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC13P55735 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC13P55735 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC13P55735 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC13P55735 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC13P55735 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC13P55735 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC13P55735 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC13P55735 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC13P55735 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC13P55735 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC13P55735 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC13P55735 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC13P55735 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms