Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
AMPHP49418 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AMPHP49418 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
AMPHP49418 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
AMPHP49418 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
AMPHP49418 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
AMPHP49418 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
AMPHP49418 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
AMPHP49418 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
AMPHP49418 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
AMPHP49418 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
AMPHP49418 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
AMPHP49418 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
AMPHP49418 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
AMPHP49418 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
AMPHP49418 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
AMPHP49418 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
AMPHP49418 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
AMPHP49418 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
AMPHP49418 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
AMPHP49418 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
AMPHP49418 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
AMPHP49418 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
AMPHP49418 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AMPHP49418 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AMPHP49418 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AMPHP49418 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
AMPHP49418 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
AMPHP49418 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
AMPHP49418 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
AMPHP49418 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
AMPHP49418 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
AMPHP49418 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
AMPHP49418 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
AMPHP49418 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
AMPHP49418 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
AMPHP49418 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
AMPHP49418 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
AMPHP49418 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
AMPHP49418 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
AMPHP49418 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AMPHP49418 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AMPHP49418 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
AMPHP49418 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AMPHP49418 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
AMPHP49418 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
AMPHP49418 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
AMPHP49418 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
AMPHP49418 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
AMPHP49418 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
AMPHP49418 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
AMPHP49418 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
AMPHP49418 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AMPHP49418 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
AMPHP49418 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
AMPHP49418 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
AMPHP49418 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AMPHP49418 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AMPHP49418 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AMPHP49418 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AMPHP49418 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
AMPHP49418 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
AMPHP49418 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
AMPHP49418 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
AMPHP49418 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
AMPHP49418 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AMPHP49418 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AMPHP49418 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AMPHP49418 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AMPHP49418 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AMPHP49418 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AMPHP49418 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AMPHP49418 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AMPHP49418 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
AMPHP49418 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AMPHP49418 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
AMPHP49418 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AMPHP49418 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
AMPHP49418 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AMPHP49418 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms