Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PIP4K2AP48426 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PIP4K2AP48426 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PIP4K2AP48426 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PIP4K2AP48426 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms