Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LIFRP42702 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LIFRP42702 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LIFRP42702 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIFRP42702 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LIFRP42702 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIFRP42702 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIFRP42702 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIFRP42702 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIFRP42702 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIFRP42702 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIFRP42702 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIFRP42702 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIFRP42702 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIFRP42702 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIFRP42702 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIFRP42702 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIFRP42702 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIFRP42702 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIFRP42702 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIFRP42702 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LIFRP42702 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LIFRP42702 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIFRP42702 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIFRP42702 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIFRP42702 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIFRP42702 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIFRP42702 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIFRP42702 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIFRP42702 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIFRP42702 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIFRP42702 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIFRP42702 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIFRP42702 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIFRP42702 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIFRP42702 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIFRP42702 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIFRP42702 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIFRP42702 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIFRP42702 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LIFRP42702 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LIFRP42702 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIFRP42702 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LIFRP42702 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIFRP42702 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIFRP42702 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIFRP42702 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIFRP42702 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIFRP42702 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIFRP42702 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIFRP42702 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIFRP42702 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIFRP42702 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIFRP42702 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIFRP42702 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIFRP42702 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIFRP42702 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIFRP42702 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIFRP42702 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIFRP42702 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIFRP42702 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIFRP42702 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIFRP42702 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIFRP42702 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LIFRP42702 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LIFRP42702 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIFRP42702 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIFRP42702 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIFRP42702 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms