Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBL1P41271 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBL1P41271 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBL1P41271 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBL1P41271 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBL1P41271 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBL1P41271 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBL1P41271 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBL1P41271 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBL1P41271 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBL1P41271 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBL1P41271 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBL1P41271 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBL1P41271 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBL1P41271 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBL1P41271 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBL1P41271 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBL1P41271 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBL1P41271 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBL1P41271 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBL1P41271 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBL1P41271 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBL1P41271 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBL1P41271 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBL1P41271 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBL1P41271 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBL1P41271 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBL1P41271 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBL1P41271 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBL1P41271 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBL1P41271 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBL1P41271 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBL1P41271 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBL1P41271 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBL1P41271 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBL1P41271 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBL1P41271 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NBL1P41271 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBL1P41271 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBL1P41271 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBL1P41271 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBL1P41271 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBL1P41271 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBL1P41271 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBL1P41271 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBL1P41271 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBL1P41271 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBL1P41271 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBL1P41271 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBL1P41271 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBL1P41271 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBL1P41271 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBL1P41271 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBL1P41271 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBL1P41271 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBL1P41271 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms