Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HADHAP40939 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHAP40939 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHAP40939 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHAP40939 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHAP40939 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHAP40939 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHAP40939 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHAP40939 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHAP40939 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHAP40939 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHAP40939 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHAP40939 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHAP40939 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHAP40939 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHAP40939 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHAP40939 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHAP40939 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHAP40939 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHAP40939 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHAP40939 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHAP40939 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHAP40939 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HADHAP40939 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHAP40939 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHAP40939 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHAP40939 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHAP40939 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHAP40939 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHAP40939 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHAP40939 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHAP40939 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHAP40939 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHAP40939 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHAP40939 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHAP40939 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHAP40939 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHAP40939 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHAP40939 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHAP40939 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHAP40939 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHAP40939 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHAP40939 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHAP40939 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHAP40939 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHAP40939 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHAP40939 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHAP40939 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHAP40939 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHAP40939 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHAP40939 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHAP40939 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHAP40939 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHAP40939 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHAP40939 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHAP40939 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHAP40939 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHAP40939 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHAP40939 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHAP40939 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHAP40939 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHAP40939 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHAP40939 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHAP40939 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHAP40939 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHAP40939 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHAP40939 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHAP40939 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHAP40939 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHAP40939 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HADHAP40939 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHAP40939 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHAP40939 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHAP40939 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHAP40939 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHAP40939 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms